其中PLOT柱主要用于*氣體和低分子量有機化合物的分離；SCOT柱所用固定液的量大一些，故柱容量大一些，但由于制備技術復雜，應用也不太普遍。毛細管GC中的主力軍是CLOT，其柱材料大多用熔融石英，即所謂彈性石英柱。

　　理論上講，選擇固定相遵循相似性原則，即：用非極性固定相分析非極性物質，用極性固定相分析極性物質，用含芳香基團的固定相分析芳香族化合物。在填充柱時代，這個想法是非常正確的，因為那個時候，分離度是首先需要把握的關鍵因素，分不開，就沒辦法想其它。它的理由在于塔板理論的推論，即：組分在固定相中有越大的溶解度差異，就會產生越大的分離度。

　　但是在毛細管色譜時代，分離度不再始終是分析的問題。毛細管具有幾十萬塊塔板，如此大的柱效率，以至于不再需要充分考慮分離問題了。這個時候，樣品兼容性、使用溫度、穩定性、柱流失情況等，都可能成為選擇的主要理由。

　　例如分析甲醇乙醇丙醇等低級醇類，正常應選擇wax類高極性色譜柱。但是在雜質較少的情況下，選擇DB-1這樣的非極性柱具有更高的靈活性和使用壽命。具體選擇主要依據以下規則：

　　因為非極性蘭化所毛細管柱具有明顯的穩定性、高使用溫度、良好的色譜峰形等有利因素，因此易分離物質應首先選用極性小的色譜柱。

　　分析氫鍵型物質用氫鍵型PEG柱更佳。

　　輕烴或*氣體用PLOT柱更佳。